Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ITSN2Q9NZM3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
ITSN2Q9NZM3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ITSN2Q9NZM3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ITSN2Q9NZM3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ITSN2Q9NZM3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ITSN2Q9NZM3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ITSN2Q9NZM3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ITSN2Q9NZM3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
ITSN2Q9NZM3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ITSN2Q9NZM3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ITSN2Q9NZM3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ITSN2Q9NZM3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ITSN2Q9NZM3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ITSN2Q9NZM3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ITSN2Q9NZM3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ITSN2Q9NZM3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
ITSN2Q9NZM3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ITSN2Q9NZM3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ITSN2Q9NZM3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ITSN2Q9NZM3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
ITSN2Q9NZM3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ITSN2Q9NZM3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
ITSN2Q9NZM3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
ITSN2Q9NZM3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
ITSN2Q9NZM3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ITSN2Q9NZM3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
ITSN2Q9NZM3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
ITSN2Q9NZM3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ITSN2Q9NZM3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ITSN2Q9NZM3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ITSN2Q9NZM3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
ITSN2Q9NZM3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ITSN2Q9NZM3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
ITSN2Q9NZM3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ITSN2Q9NZM3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ITSN2Q9NZM3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ITSN2Q9NZM3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ITSN2Q9NZM3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
ITSN2Q9NZM3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
ITSN2Q9NZM3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ITSN2Q9NZM3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
ITSN2Q9NZM3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ITSN2Q9NZM3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms