Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN3BQ9NY72 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN3BQ9NY72 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN3BQ9NY72 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN3BQ9NY72 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN3BQ9NY72 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN3BQ9NY72 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN3BQ9NY72 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN3BQ9NY72 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN3BQ9NY72 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN3BQ9NY72 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms