Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB1

RBFOX1, RNA binding protein fox-1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX1Q9NWB1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBFOX1Q9NWB1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBFOX1Q9NWB1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBFOX1Q9NWB1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBFOX1Q9NWB1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBFOX1Q9NWB1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBFOX1Q9NWB1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBFOX1Q9NWB1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBFOX1Q9NWB1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBFOX1Q9NWB1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBFOX1Q9NWB1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBFOX1Q9NWB1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms