Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVV0

TMEM38B, Trimeric intracellular cation channel type B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38BQ9NVV0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM38BQ9NVV0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM38BQ9NVV0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM38BQ9NVV0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM38BQ9NVV0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM38BQ9NVV0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM38BQ9NVV0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM38BQ9NVV0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM38BQ9NVV0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM38BQ9NVV0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM38BQ9NVV0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM38BQ9NVV0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM38BQ9NVV0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM38BQ9NVV0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM38BQ9NVV0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms