Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD3AQ9NVI7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3AQ9NVI7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD3AQ9NVI7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms