Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDP1Q9NUW8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDP1Q9NUW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDP1Q9NUW8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDP1Q9NUW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDP1Q9NUW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDP1Q9NUW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDP1Q9NUW8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDP1Q9NUW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDP1Q9NUW8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDP1Q9NUW8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDP1Q9NUW8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDP1Q9NUW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDP1Q9NUW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TDP1Q9NUW8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP1Q9NUW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP1Q9NUW8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP1Q9NUW8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDP1Q9NUW8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TDP1Q9NUW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDP1Q9NUW8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDP1Q9NUW8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDP1Q9NUW8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDP1Q9NUW8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDP1Q9NUW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDP1Q9NUW8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDP1Q9NUW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDP1Q9NUW8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDP1Q9NUW8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDP1Q9NUW8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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