Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GINM1Q9NU53 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GINM1Q9NU53 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GINM1Q9NU53 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GINM1Q9NU53 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GINM1Q9NU53 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GINM1Q9NU53 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GINM1Q9NU53 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GINM1Q9NU53 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GINM1Q9NU53 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GINM1Q9NU53 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GINM1Q9NU53 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GINM1Q9NU53 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GINM1Q9NU53 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GINM1Q9NU53 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GINM1Q9NU53 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GINM1Q9NU53 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GINM1Q9NU53 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GINM1Q9NU53 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GINM1Q9NU53 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GINM1Q9NU53 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms