Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD18Q9NS91 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD18Q9NS91 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD18Q9NS91 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD18Q9NS91 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD18Q9NS91 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD18Q9NS91 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms