Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LTBP3Q9NS15 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LTBP3Q9NS15 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LTBP3Q9NS15 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LTBP3Q9NS15 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
LTBP3Q9NS15 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LTBP3Q9NS15 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LTBP3Q9NS15 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LTBP3Q9NS15 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LTBP3Q9NS15 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LTBP3Q9NS15 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LTBP3Q9NS15 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LTBP3Q9NS15 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
LTBP3Q9NS15 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LTBP3Q9NS15 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LTBP3Q9NS15 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
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