Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLSCR3Q9NRY6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLSCR3Q9NRY6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLSCR3Q9NRY6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLSCR3Q9NRY6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLSCR3Q9NRY6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms