Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH3

TUBG2, Tubulin gamma-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG2Q9NRH3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBG2Q9NRH3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBG2Q9NRH3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG2Q9NRH3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBG2Q9NRH3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms