Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARHGEF4Q9NR80 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGEF4Q9NR80 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF4Q9NR80 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ARHGEF4Q9NR80 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGEF4Q9NR80 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
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