Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRCC1Q9NPI7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRCC1Q9NPI7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRCC1Q9NPI7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms