Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms