Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRD7Q9NPI1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD7Q9NPI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD7Q9NPI1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD7Q9NPI1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms