Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELL3Q9HB65 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELL3Q9HB65 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELL3Q9HB65 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELL3Q9HB65 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELL3Q9HB65 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms