Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FKRPQ9H9S5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FKRPQ9H9S5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FKRPQ9H9S5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FKRPQ9H9S5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms