Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VIPAS39Q9H9C1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VIPAS39Q9H9C1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VIPAS39Q9H9C1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VIPAS39Q9H9C1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VIPAS39Q9H9C1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIPAS39Q9H9C1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIPAS39Q9H9C1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VIPAS39Q9H9C1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIPAS39Q9H9C1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms