Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8P0

SRD5A3, Polyprenol reductase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRD5A3Q9H8P0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRD5A3Q9H8P0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRD5A3Q9H8P0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRD5A3Q9H8P0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRD5A3Q9H8P0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228 ms