Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MFSD1Q9H3U5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MFSD1Q9H3U5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MFSD1Q9H3U5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MFSD1Q9H3U5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MFSD1Q9H3U5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFSD1Q9H3U5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD1Q9H3U5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms