Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACTR3CQ9C0K3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTR3CQ9C0K3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTR3CQ9C0K3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTR3CQ9C0K3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTR3CQ9C0K3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms