Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRC27Q9C0I9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC27Q9C0I9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC27Q9C0I9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC27Q9C0I9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC27Q9C0I9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC27Q9C0I9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC27Q9C0I9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC27Q9C0I9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC27Q9C0I9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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LRRC27Q9C0I9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC27Q9C0I9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC27Q9C0I9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC27Q9C0I9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC27Q9C0I9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
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LRRC27Q9C0I9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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LRRC27Q9C0I9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC27Q9C0I9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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LRRC27Q9C0I9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
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LRRC27Q9C0I9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC27Q9C0I9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC27Q9C0I9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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LRRC27Q9C0I9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC27Q9C0I9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
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LRRC27Q9C0I9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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LRRC27Q9C0I9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRC27Q9C0I9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
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LRRC27Q9C0I9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
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LRRC27Q9C0I9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
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LRRC27Q9C0I9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRC27Q9C0I9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC27Q9C0I9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRC27Q9C0I9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC27Q9C0I9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC27Q9C0I9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC27Q9C0I9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC27Q9C0I9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRC27Q9C0I9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
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