Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL4Q9C0H6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL4Q9C0H6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL4Q9C0H6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL4Q9C0H6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL4Q9C0H6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL4Q9C0H6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL4Q9C0H6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL4Q9C0H6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL4Q9C0H6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL4Q9C0H6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL4Q9C0H6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms