Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMBRA1Q9C0C7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AMBRA1Q9C0C7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMBRA1Q9C0C7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AMBRA1Q9C0C7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms