Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM8Q9BZR9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM8Q9BZR9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM8Q9BZR9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM8Q9BZR9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms