Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFIH1Q9BYX4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFIH1Q9BYX4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFIH1Q9BYX4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFIH1Q9BYX4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFIH1Q9BYX4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms