Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSBP4Q9BWG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP4Q9BWG4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSBP4Q9BWG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSBP4Q9BWG4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms