Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SELENOOQ9BVL4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SELENOOQ9BVL4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SELENOOQ9BVL4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SELENOOQ9BVL4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SELENOOQ9BVL4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SELENOOQ9BVL4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms