Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PBDC1Q9BVG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PBDC1Q9BVG4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PBDC1Q9BVG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PBDC1Q9BVG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.6 ms