Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD7Q9BUK0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHCHD7Q9BUK0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD7Q9BUK0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD7Q9BUK0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms