Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDC1Q9BTX1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NDC1Q9BTX1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDC1Q9BTX1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDC1Q9BTX1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDC1Q9BTX1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms