Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT92

TCHP, Trichoplein keratin filament-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCHPQ9BT92 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCHPQ9BT92 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCHPQ9BT92 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCHPQ9BT92 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCHPQ9BT92 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCHPQ9BT92 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCHPQ9BT92 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCHPQ9BT92 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCHPQ9BT92 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TCHPQ9BT92 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCHPQ9BT92 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCHPQ9BT92 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCHPQ9BT92 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TCHPQ9BT92 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCHPQ9BT92 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms