Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX7Q9BT81 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX7Q9BT81 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX7Q9BT81 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX7Q9BT81 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms