Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM246Q9BRR3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM246Q9BRR3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM246Q9BRR3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM246Q9BRR3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM246Q9BRR3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms