Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLX1AQ9BQ83 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLX1AQ9BQ83 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLX1AQ9BQ83 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLX1AQ9BQ83 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLX1AQ9BQ83 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms