Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCAPGQ9BPX3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCAPGQ9BPX3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPGQ9BPX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPGQ9BPX3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPGQ9BPX3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPGQ9BPX3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPGQ9BPX3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPGQ9BPX3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPGQ9BPX3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPGQ9BPX3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPGQ9BPX3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPGQ9BPX3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPGQ9BPX3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPGQ9BPX3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms