Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
RGPD5Q99666 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RGPD5Q99666 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD5Q99666 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RGPD5Q99666 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RGPD5Q99666 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
RGPD5Q99666 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RGPD5Q99666 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RGPD5Q99666 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RGPD5Q99666 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD5Q99666 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD5Q99666 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
RGPD5Q99666 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
RGPD5Q99666 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms