Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHCQ99643 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHCQ99643 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHCQ99643 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHCQ99643 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms