Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC38A3Q99624 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC38A3Q99624 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC38A3Q99624 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC38A3Q99624 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC38A3Q99624 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A3Q99624 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC38A3Q99624 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A3Q99624 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms