Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOTCH4Q99466 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOTCH4Q99466 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOTCH4Q99466 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NOTCH4Q99466 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NOTCH4Q99466 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOTCH4Q99466 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOTCH4Q99466 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOTCH4Q99466 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOTCH4Q99466 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOTCH4Q99466 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOTCH4Q99466 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOTCH4Q99466 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOTCH4Q99466 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOTCH4Q99466 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOTCH4Q99466 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms