Protein–RNA interactions for Protein: Q96T83

SLC9A7, Sodium/hydrogen exchanger 7, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A7Q96T83 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms