Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLRE1CQ96SD1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLRE1CQ96SD1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1CQ96SD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1CQ96SD1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms