Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF13CQ96RJ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF13CQ96RJ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF13CQ96RJ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms