Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC138Q96M89 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC138Q96M89 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC138Q96M89 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC138Q96M89 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 436.1 ms