Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAGED4Q96JG8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MAGED4Q96JG8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGED4Q96JG8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGED4Q96JG8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGED4Q96JG8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms