Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22AQ96IW7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22AQ96IW7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC22AQ96IW7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms