Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BICD1Q96G01 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BICD1Q96G01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BICD1Q96G01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BICD1Q96G01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BICD1Q96G01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms