Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MRPL53Q96EL3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MRPL53Q96EL3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL53Q96EL3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL53Q96EL3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL53Q96EL3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MRPL53Q96EL3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms