Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPDL1Q96EA4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPDL1Q96EA4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPDL1Q96EA4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPDL1Q96EA4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms