Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM44Q96DX7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM44Q96DX7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM44Q96DX7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM44Q96DX7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM44Q96DX7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM44Q96DX7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM44Q96DX7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM44Q96DX7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM44Q96DX7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM44Q96DX7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms