Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERP27Q96DN0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERP27Q96DN0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ERP27Q96DN0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ERP27Q96DN0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERP27Q96DN0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms